Científicos del Centro de Regulación Genómica (CRG) de Barcelona han desarrollado una nueva herramienta que permite utilizar moléculas de ARNt como biomarcadores para el diagnóstico de cánceres y hacerlo en un futuro próximo en menos de tres horas y A un coste de menos de 50 euros por muestra.
Los científicos, que publicaron su trabajo el jueves en la revista Nature Biotechnology, lograron por primera vez desarrollar un método para medir la abundancia y las modificaciones del ARNt de una manera simple y económica, utilizando Aplicaciones de diagnóstico prometedoras y predicción de enfermedades, y que además es una prueba no invasiva con alta sensibilidad y especificidad.
Este método fue desarrollado por el grupo de investigación eva novoa En el CRG de Barcelona, financiado por la Sociedad Española Contra el Cáncer, el método se está usando ahora como base para desarrollar un nuevo kit y plataforma que será capaz de determinar si una muestra biológica es cancerosa y predecir su malignidad en menos de 3 horas y con un coste inferior a 50 euros la muestra.
Como explicó Novoa, cuando moléculas de ARN de transferencia (ARN) Se modifican incorrectamente, lo que da como resultado proteínas defectuosas o incompletas, que están asociadas con diversas enfermedades humanas, como la neurodegeneración, el metabolismo y el cáncer.
“El ARN son moléculas que contienen mucha información y tienen un enorme potencial para diagnosticar enfermedades, predecir su tratamiento y, hasta ahora, No ha sido explotado por falta de métodos. Esta información se puede capturar de forma cuantitativa y rentable”, según el investigador, quien pone como ejemplo que algunos tipos de cáncer son difíciles de diagnosticar porque sus síntomas no son específicos y pueden confundirse con otras condiciones.
«La capacidad de aislar moléculas de ARNt de muestras de sangre e identificar sus modificaciones puede ayudar a diagnosticar cánceres sin el uso de pruebas de imagen o biopsias invasivas. Además, el tipo de modificaciones de ARNt puede cambiar según el estado de la enfermedad». Proporcionar información valiosaagregó Novoa.
Los métodos actuales para cuantificar moléculas de ARNt generalmente incluyen técnicas como secuenciación de próxima generación o espectrometría de masas, con limitaciones en el diagnóstico porque no pueden detectar alteraciones o no pueden determinar dónde se encuentran en la molécula de tRNA.
Este nuevo método se llama nano-ARNtseqSegún los científicos del CRG, pueden medir la abundancia y las modificaciones de las moléculas de ARN en un solo paso y confiar en la nanosecuenciación, una técnica que puede secuenciar directamente las moléculas de ARN al pasarlas a través de pequeños poros y detectar cambios en la electricidad. La corriente que se crea cuando cada nucleótido pasa a través del poro.
Antes de confiar en dos métodos separados, menos informativos, Tardará semanas y costará miles de euros para obtener resultados. Nano-tRNAseq es mucho más barato y podemos obtener resultados en un par de días. En un futuro próximo, será en unas horas”, apunta el investigador del CRG Morgan Lucas.
Máquinas pequeñas y ligeras
Otra ventaja es que las máquinas de nanosecuenciación para usar Nano-tRNAseq son pequeñas, livianas y pueden operarse Con un portátil o una batería externaEsto facilita su transporte y permite su uso en el campo o en la clínica.
Aunque todavía existen algunas limitaciones en el nuevo método, que se probó con ARN de levadura, Lucas dice que «el uso de Nano-tRNAseq en paralelo con otros métodos hace posible caracterizar los perfiles de modificación de un conjunto completo de ARNt en humanos y, en el futuro, use Nano-tRNAseq para identificar ¿Qué cambios en el ARN están asociados con una enfermedad en particular?«.
«Nano-tRNAseq es una tecnología de prueba de concepto que allana el camino para el desarrollo de un método simple, económico y de alta resolución que puede identificar de forma no invasiva estas moléculas. Nuestro objetivo es seguir desarrollando esta tecnología e integrarla con herramientas de inteligencia artificial Determinar la malignidad de una muestra biológica en menos de tres horas y con un coste no superior a 50 euros por muestra.