Descubrir «microbioma alimentario» Ayuda a comprender mejor la composición de las poblaciones de bacterias y hongos que habitan en nuestro intestino e influyen en la salud. Él La base de datos más grande de genomas de bacterias y hongos publicada hoy jueves celúlamuestra que los microbios asociados a los alimentos comprenden un promedio del 3% del microbioma intestinal en adultos y el 56% en bebés.
De más de 2500 metagenomas alimentarios.Sí Un equipo multicéntrico europeo de investigadores de 14 países, entre ellos España, caracterizó los genomas de más de 10.800 microorganismos; bacterias y hongos– se encuentra en los alimentos. De esta manera, sientan las bases para profundizar en cómo les afecta Los seres vivos en nuestra propia salud..
Los hallazgos son resultados. consorcio europeo Aplicaciones del microbioma para sistemas alimentarios sostenibles (MAESTRO-h2020)en el que participan muchos grupos de diferentes países. Entre ellos se encuentran el Instituto Lácteo de Asturias (IPLA-CSIC), en Villaviciosa, y el Instituto de Investigación Sanitaria del Estado de Asturias (ISPA), en Oviedo (ambos en Asturias); Departamento de Tecnología e Higiene de los Alimentos, Universidad Lenny; Estación Experimental El Zeidn (ZEE-CSIC), Granada; Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL, CSIC-UAM); El Instituto de Investigación en Agrobiotecnología (CIALE) de la Universidad de Salamanca y el Instituto de Agroquímica y Tecnología de Alimentos (IATA-CSIC) de Paterna (Valencia).
Raúl Cabrera RubioInvestigador y colaborador del proyecto Cdeigen del IATA-CSIC celúlaseñala que la “proporción de esta amplia participación Múltiples secuencias de múltiples entornos y ubicaciones de muestreo.que cubren el sistema alimentario desde el abdomen [cavidad del aparato digestivo de los animales rumiantes] hasta el pescado; fábricas; pisos; alimentos fermentados; cereales y hortalizas». y el lo menciona Los metadatos recopilados están abiertos al acceso público en la base de datos. Comida curadaMetagenomicData.
Una exhaustiva investigación nos ha permitido averiguarlo Especies y su información genómica comúnmente utilizadas en la producción de alimentos.. Además, “hemos descubierto cientos de especies no caracterizadas en el microbioma alimentario, lo que abre nuevas vías para su caracterización en profundidad”, afirma el científico del Centro de Valencia.
Y recuerda que ‘la integración de estos recursos ha permitido el desarrollo de varios aplicaciones relevantesDesde el estudio de la evolución del microbioma en el sistema alimentario, hasta la propagación de resistencias a antibióticos o genes asociados al deterioro de los alimentos, pasando por la detección de patógenos en el control de calidad de los alimentos, y finalmente al estudio de su transmisión. la cadena alimentaria humana.
Metagenómica aplicada a los alimentos
En lugar de cultivar microbios alimentarios individualmente en el laboratorio, los investigadores han recurrido a herramientas que permiten secuenciar simultáneamente todo el material genético de cada muestra de alimento. Esta fórmula metagenómica se utiliza a menudo para caracterizar el microbioma humano o analizar muestras ambientales, pero hasta ahora no se ha utilizado para investigaciones alimentarias a gran escala.
Se encontraron 2.533 metagenomas de microorganismos asociados a alimentos de 50 países en una variedad de alimentos, el 65% de los cuales eran productos lácteos, el 17% eran bebidas fermentadas y el 5% eran carnes fermentadas. Los metagenomas contenían material genético de 10.899 microbios asociados a alimentos clasificados en 1.036 especies de bacterias y 108 especies de hongos.
Uno de los datos extraídos del trabajo, según destaca el coautor principal del trabajo Nicola SegataLa Universidad de Trento y el Instituto Europeo de Oncología de Milán han establecido que las especies microbianas asociadas a los alimentos comprenden aproximadamente el 3% del microbioma intestinal de los adultos y más del 50% del microbioma intestinal de los bebés. «Puede parecer un porcentaje pequeño, pero ese 3% será sumamente relevante por su función en nuestro organismo.. Con esta base de datos, podemos comenzar a estudiar a escala cómo las propiedades microbianas de los alimentos pueden afectar nuestra salud». El hallazgo también sugiere que “Algunas de las bacterias de nuestro intestino se pueden obtener directamente de los alimentos.o que históricamente las poblaciones humanas adquirieron estos microbios de los alimentos y luego estos microbios se adaptaron para formar parte del microbioma humano».
Las investigaciones han demostrado que alimentos similares tienden a contener tipos similares de bacterias; por ejemplo, las comunidades microbianas de diferentes bebidas fermentadas son más similares entre sí que con los microbios presentes en las carnes fermentadas. Sin embargo, se observó una mayor variación en los tipos de microorganismos en los productos lácteos, probablemente debido al mayor número de productos lácteos estudiados.
“Lo sorprendente es Algunos microbios existen y realizan funciones similares incluso en alimentos muy diferentes. y, al mismo tiempo, demostramos que la comida de cada establecimiento o finca local tiene características únicas”, afirma Segata. “Esto es importante porque profundiza la idea de las características y calidad de los alimentos locales, y podríamos: incluso usar metagenómica certificar que los alimentos provienen de una instalación o ubicación en particular«.
Aunque los investigadores no han identificado muchos bacterias patógenas En las muestras de alimentos, confirmaron la presencia de ciertos microbios que podrían ser menos deseables debido a su efecto sobre el sabor o la conservación de los alimentos, un hecho que podría ayudar a producir un producto más consistente y deseable. También puede contribuir a los aspectos regulatorios y la trazabilidad al proporcionar información sobre qué microbios deben y no deben estar presentes en ciertos tipos de alimentos, así como sobre la identidad y el origen de los alimentos locales.
Ral Cabrera también destaca, entre otras conclusiones citadas de este exhaustivo estudio, que “el análisis a nivel de cepa ha inferido posibles eventos recientes de transmisión del alimento al microbioma también para eucariotas, tales como: Saccharomyces cerevisiae«.
De hecho, también descubrieron la presencia de levadura. Debaryomyces hanseniiun hecho que los investigadores destacaron en el estudio como muestra la importancia de los hongosy levaduras en particular al estudiar la diversidad de microbiomas alimentarios.
«El conocimiento profundo de los microbios alimentarios ha permitido conectarlos con la microbiota humana, tanto en adultos como en niños, pudiendo conocer uno de los pilares de su formación y pudiendo proporcionar una base para su regulación. , así como su impacto en las enfermedades no transmisibles», concluye Ral Cabrera.
«Es necesario añadir que la caracterización funcional de estos microbios, que sólo descubrimos a través de la metagenómica, debería ser el siguiente paso para explotar aún más su papel en el procesamiento, la calidad y la seguridad de los alimentos. La diversidad global de microbios alimentarios aún está lejos de ser descifrada y, como tal, nuestro recurso debería ser el punto de partida para iniciativas integradoras adicionales sobre microbiomas alimentarios.. «Por ejemplo, nuestros hallazgos respaldan las herramientas de tipificación molecular para desarrollar certificados de autenticidad y origen de los alimentos basados en características microbianas, lo que requerirá una mayor expansión del número de metagenomas de la misma especie alimentaria de diferentes lugares e industrias».
Para: Christian Díaz-MuozUn becario postdoctoral del Laboratorio de Genética Gastrointestinal del CIC bioGUNE-BRTA de Derio (Vizcaya), habla de este estudio de SMC España, en el que no participó, que “representa el mayor esfuerzo hasta la fecha para caracterizar microbianamente alimentos; La base de datos seleccionada (curatedFoodMetagenomicData, cFMD), específica de alimentos fermentados, representa sin duda un auténtico atlas para cualquier microbiólogo y, por tanto, un punto de partida para futuras investigaciones en biotecnología alimentaria”.
El investigador del CIC-Biogune también aporta que el trabajo «demuestra la llamada dimensión». materia oscura microbiana que continúa hasta el día de hoy en el mundo de la microbiología en general y en la microbiología de los alimentos en particular, con implicaciones directas en aspectos tan importantes e inmediatos como la seguridad alimentaria.’
Y eso alude a la conexión entre la microbiología de los alimentos y la microbiota humana que se estableció en el estudio. celúlaeso no sólo «confirma el dicho de que ‘somos lo que comemos'», sino que reafirma las bases sobre las que se basan los alimentos probióticos de calidad. que contienen microorganismos que se ha demostrado que colonizan el tracto digestivo y tienen un efecto positivo en la salud intestinal.
